Teka-teki mengenai kekebalan yang dimiliki Ellie terhadap infeksi Cordyceps dan pengaruhnya terhadap orang lain.
Dalam serial ‘The last of Us’, kekebalan Ellie terhadap infeksi Cordyceps yang menghancurkan sebagian besar peradaban manusia adalah alasan utama Joel yang ditugaskan untuk mengawalnya agar darahnya dapat dipakai untuk membuat serum. Infeksi yang disebabkan oleh jamur Cordyceps pada umumnya disebabkan oleh gigitan dari orang yang telah terinfeksi dan dengan cepat menyebar ke otak dan secara cepat pula mengikis fungsi otak dan menjadikan inang yang terinfeksi sangat agresif dalam hitungan hari.
Lama kelamaan mereka yang terinfeksi akan bermutasi menjadi makhluk mengerikan saat jamur parasit tersebut telah sepenuhnya mengambil alih kendali atas tubuh mereka. Akan tetapi hal semacam itu tidak terjadi pada Ellie, dia digigit beberapa minggu sebelum narasi utama dimulai seperti yang terlihat pada episode pertamanya.
Kemudian Ellie terlihat digigit lagi oleh Clickers pada episode 2. Tapi tak ada satu pun dari gigitan ini memengaruhinya dengan sifat kekebalannya yang tidak jelas dan apa yang terjadi pada episode 8, di mana dalam satu adegan ketika Ellie menggigit David menimbulkan pertanyaan yang menarik apakah Ellie berpotensi menularkan orang lain?
Ada kemungkinan, Ellie tidak secara khusus kebal dari jamur parasit Cordyceps, karena jamur tersebut masih ada dalam tubuhnya yang artinya bahwa sementara Ellie tetap terinfeksi oleh Cordyceps tapi infeksi tersebut tidaklah mempengaruhi dirinya dengan cara yang sama seperti yang lainnya.
Dalam kasus ini, Cordyceps dalam tubuh Ellie telah bermutasi menjadi strain yang tidak mematikan dan tidak menyebabkan keagresifan, penyebar penyakit yang terlihat di ‘The Last of Us‘.
Sementara itu, ada ketakutan lain yang diperlihatkan oleh Ellie saat dia membuat seseorang bernama Cat telah terinfeksi saat mereka berciuman. Ellie merasa air liurnya dapat menyebabkan infeksi kepada Cat. Ellie lalu memperhatikan Cat secara cermat dan kekhawatirannya ternyata tidak terbukti karena ternyata Cat tidak berubah menjadi monster dan menandakan bahwa air liurnya bukanlah sarana kontaminasi. Meski belum ada kejelasan tentang kekebalan yang dimilki Ellie tapi sampai sekarang sudah cukup jelas bahwa Ellie tidak mampu menginfeksi orang lain.